• Frère aîné du buteur du SV Werder Bremen, Felix Kroos, Toni passe quatre années au centre de formation du FC Hansa Rostock avant de rejoindre le Bayern à l'âge de 16 ans, en juillet 2006.

• Il sort de l'anonymat lors du Championnat d'Europe des moins de 17 ans de l'UEFA 2006 au Luxembourg – où sa sélection termine quatrième – grâce notamment à son titre de Joueur en Or. L'année suivante, en phase finale, il partage la première place au classement des meilleurs buteurs et décroche le Ballon d'Or à la Coupe du Monde FIFA des moins de 17 ans en République de Corée quelques mois après, en inscrivant cinq buts en six matches.

• La quatrième journée d'UEFA Champions League 2008/09 marque ses débuts européens, contre l'ACF Fiorentina. Il passe la seconde moitié de la saison en prêt à Leverkusen, avec qui il joue la finale de la Coupe d'Allemagne. Il reste finalement à la BayArena en 2009/10 et y réalise sa meilleure saison (neuf buts en 33 matches de championnat).

• Il apparaît pour la première fois en sélection lors d'un amical contre l'Argentine le 3 mars 2010 et s'envole la même année pour l'Afrique du Sud et la Coupe du Monde FIFA. Il apparaît quatre fois sur la feuille de match aux côtés des autres remplaçants, alors que sa sélection termine troisième.

• Muet en neuf matches pour la Nationalmannschaft lors des éliminatoires pour l'UEFA EURO 2012, il finit par trouver le chemin des filets contre ses co-organisateurs, la Pologne (2-2) et l'Ukraine (3-3) en amical à l'automne 2011.